バイオディーゼル燃料の製造法には、 「アルカリ触媒法」、「酸触媒法」、「酵素法」、「超臨界法」など、 さまざまな技法があります。 それぞれに異なる特徴がありますが、 食用廃油再生燃料化装置「EOSYS」が採用しているのは、 EUをはじめ世界的にもっとも多く用いられている「アルカリ触媒法」です。 アルカリ触媒法では、植物油にメタノールと苛性ソーダなどの アルカリ触媒を加え、エステル交換反応と呼ばれる化学反応をおこさせます。 エステル交換反応により メタノールと油のなかに含まれる粘度の高いグリセリンが入れ替わり、 脂肪酸メチルエステル（バイオディーゼル燃料）が生成されるのです。 　 　 　 　 また、品質の高いバイオディーゼル燃料を製造するためには、 生成された脂肪酸メチルエステルを精製することが不可欠です。 「EOSYS」では、水洗洗浄によって不純物を取り除く「湿式精製法」を用い、 水洗洗浄を行ったあと加温脱水を行います。 この工程を経ることで、ハイクオリティーなバイオディーゼル燃料が製造できます。 （参考）平成16年6月に竣工した京都市廃食油燃料化施設では、 燃料製造時のエネルギー消費が少なく、 技術的に実用レベルにある製造技術を対象として 検討した結果から、 世界中で採用実例の多い「アルカリ触媒法−湿式洗浄方式」を採用しています。